E1: Asaltul: Partea 2
Lansat: 04 Sep 1996
Kazonii sechestrează nava Voyager și abandonează echipajul pe o planetă părăsită. La bord rămân doar doctorul, Paris și Suder, care încearcă să reia controlul.
E2: Amintire
Lansat: 11 Sep 1996
Cpt. Janeway se supune unei fuziuni mentale cu Tuvok, care retrăiește experiențe de pe nava USS Excelsior, sub comanda cpt. Sulu.
E3: Toboganul
Lansat: 18 Sep 1996
Tom Paris și Harry Kim sunt condamnați pe nedrept pentru bombardamente teroriste. Deși Janeway capturează adevărații vinovați, Tom și Harry sunt închiși.
E4: Roiul
Lansat: 25 Sep 1996
Voyager este atacată de o mulțime de nave minuscule. Doctorul își pierde memoria, iar Torres activează un program controlat de o hologramă familiară.
E5: Profituri false
Lansat: 02 Oct 1996
După întâlnirea cu doi ferengi autoproclamați zei pe o planetă primitivă, echipajul plănuiește să folosească gaura de vierme din apropiere pentru a se întoarce spre casă.
E6: Rememorare
Lansat: 09 Oct 1996
Lt. Torres începe să aibă vise foarte intense despre o altă viață, o altă iubire și o altă planetă.
E7: Tărâm sacru
Lansat: 30 Oct 1996
După ce Kes e rănit în urma contactului cu câmpul energetic din jurul tărâmului sacru al planetei, Janeway pornește într-o căutare spirituală pentru a-și salva viața.
E8: Sfârşitul viitorului: Partea 1
Lansat: 06 Nov 1996
O navă temporală este teleportată în secolul al XX-lea, împreună cu Voyager, iar echipajul găsește o companie din 1996 care a profitat de pe urma tehnologiei viitorului.
E9: Sfârşitul viitorului: Partea 2
Lansat: 13 Nov 1996
Henry Starling a făcut o avere subtilizând tehnologia secolului al XXIX-lea de pe nava spațială prăbușită, iar lăcomia îl determină să plănuiască o călătorie în viitor.
E10: Războinicul
Lansat: 20 Nov 1996
Un despot războinic pe moarte pune stăpânire pe corpul lui Kes și este hotărât să-și cucerească planeta.
E11: Seducătorul Q
Lansat: 27 Nov 1996
După decesul la ultima vizită pe Voyager, Q trebuie înlocuit, iar necruțătorul Q, familiar celor de pe Enterprise, și-o dorește pe Janeway drept parteneră.
E12: Macrocosmos
Lansat: 11 Dec 1996
Reveniți dintr-o primă misiune de contact, Janeway, Neelix și doctorul trebuie să salveze Voyager de o infestare cu microorganisme.
E13: Un schimb echitabil
Lansat: 08 Jan 1997
Voyager se îndreaptă către o zonă din spațiu pe care Neelix nu o cunoaște, așa că încearcă să obțină o hartă de la un prieten cu o reputație îndoielnică.
E14: Alter Ego
Lansat: 15 Jan 1997
Harry Kim se îndrăgostește de Marayna, un personaj din programul stațiunii polineziene dezvoltat de Neelix pe holopunte.
E15: Final
Lansat: 29 Jan 1997
Chakotay și Janeway se prăbușesc pe o planetă și sunt blocați într-o buclă temporală în care aceasta moare.
E16: Febra sângelui
Lansat: 05 Feb 1997
Vorik participă la ritualul de împerechere al vulcanienilor. Dezechilibrul chimic puternic o afectează și pe B'Elanna Torres, care se comportă irațional.
E17: Unitate
Lansat: 12 Feb 1997
Chakotay descoperă o planetă pe care sunt abandonate drone borg din întreaga galaxie.
E18: Trăsături întunecate
Lansat: 19 Feb 1997
Doctorul include personalitățile mai multor figuri istorice în programul său. B'Elanna îl avertizează asupra posibilelor consecințe nedorite.
E19: Înălţare
Lansat: 26 Feb 1997
Neelix și Tuvok sunt blocați pe suprafața unei planete bombardate de asteroizi. Atitudinea negativă a lui Tuvok începe să îl calce pe nervi pe Neelix.
E20: Fiul favorit
Lansat: 19 Mar 1997
Kim se confruntă cu modificări bizare de ADN și duce instinctiv nava Voyager pe o planetă ai cărei locuitori pretind că el ar aparține rasei lor.
E21: Înainte şi după
Lansat: 09 Apr 1997
Cu finalul aproape, Kes retrăiește diferite momente ale vieții, deplasându-se în timp. Doctorul creează o procedură experimentală pentru a-i prelungi viața.
E22: Ca în viaţa reală
Lansat: 23 Apr 1997
Doctorul creează o familie holografică, însă B'Elanna crede că simularea este prea siropoasă, așa că o modifică pentru mai multă acuratețe.
E23: Origini îndepărtate
Lansat: 30 Apr 1997
Doi savanți reptilieni voth găsesc rămășițele unui membru al echipajului Voyager pe planeta unde au fost exilați de curând de kazoni.
E24: Substituiri
Lansat: 07 May 1997
Unul câte unul, membrii echipajului de pe Voyager sunt înlocuiți cu străini care nu înțeleg de ce anume se află acolo.
E25: În cel mai rău caz
Lansat: 14 May 1997
Membrii echipajului de pe Voyager participă clandestin la un program secret pe holopunte, unde membrii Maquis de pe navă pun la cale o revoltă.
E26: Scorpion: Partea 1
Lansat: 21 May 1997
Înainte de a intra în spațiul Borg, echipajul de la bordul Voyager descoperă o amenințare atât de devastatoare încât nici cei din rasa Borg nu îi pot face față.