E1: Înălţarea (1)
Lansat: 15 Jul 2004
O nouă echipă a Porții Stelare se îmbarcă într-o misiune periculoasă într-o galaxie îndepărtată, unde descoperă un oraș mitic pierdut - și un inamic mortal nou.
E2: Înălţarea (2)
Lansat: 15 Jul 2004
Sheppard încearcă să o convingă pe Weir să organizeze o misiune de salvare pentru ai elibera pe colonelul Sumner, Teyla și pe ceilalți capturati de Wraith.
E3: De-a v-aţi ascunselea
Lansat: 23 Jul 2004
Baza Atlantidei este amenințată atunci când echipa descoperă că o entitate străină se află în oraș. Experimentul lui McKay cu tehnologie extraterestră se înrăutățește.
E4: Treizeci și opt de minute
Lansat: 30 Jul 2004
Echipa se află în pericol de moarte atunci când nava Puddle Jumper este înțepenită în Poarta Stelară.
E5: Suspiciunea
Lansat: 06 Aug 2004
După o serie de întâlniri cu Wraith, echipa începe să-i suspecteze pe aliații lor Athosieni că au un spion în mijlocul lor.
E6: Sfârșitul copilăriei
Lansat: 13 Aug 2004
Sheppard și echipa vizitează o lume în care nimeni nu are peste 24 de ani - din cauza unui ritual de sinucidere practicată cu care ei cred că îi țin pe Wraith la distanță.
E7: Otrăvind fântâna
Lansat: 20 Aug 2004
Echipa găsește o lume a cărei popor se află la un pas de o descoperire care îi poate face imuni la hrănirea lui Wraith.
E8: Sub pământ
Lansat: 27 Aug 2004
Eforturile de a deschide relații comerciale cu o specie numită Genii, i-a o întorsătură rea când echipa descoperă că noii "aliați", au motive ascunse.
E9: Acasă
Lansat: 10 Sep 2004
Eforturile lui McKay de a valorifica energia atmosferei unei planete străine permit o călătorie înapoi pe Pământ - dar echipa ar putea să nu poată reveni la Atlantida.
E10: Furtuna (1)
Lansat: 17 Sep 2004
Când o furtună masivă amenință orașul, Atlantida este evacuată - doar pentru a fi cucerită de cel mai nou inamic al echipei.
E11: Ochiul furtunii (2)
Lansat: 08 Nov 2004
Maiorul Sheppard joacă un joc periculos de-a pisica și șoarecele cu soldații care au preluat controlul asupra Atlantidei și i-au luat pe Weir și McKay ostatici.
E12: Provocatorul
Lansat: 15 Nov 2004
Echipa lui Sheppard investighează o navă Wraith doborâtă și se trezesc blocați pe o planetă cu un supraviețuitor singuratic Wraith.
E13: Zona contaminată
Lansat: 22 Nov 2004
Aproape o treime din locuitorii Atlantidei sunt infectați cu un virus mortal care provoacă halucinații și moarte, forțând o auto-blocare a orașului.
E14: Sanctuarul
Lansat: 29 Nov 2004
Echipa găsește o lume paradisiacă care ar fi un sanctuar ideal pentru cei care fug de Wraith, dar locuitorii de aici cred că zeița lor nu o va permite.
E15: Înainte de a adormi
Lansat: 06 Dec 2004
O femeie este găsită în hibernare în Atlantida, iar echipa este șocată să vadă că e însăși Dr. Weir, care le povestește despre călătoria ei cu 10.000 de ani în trecutul orașului.
E16: Frăția
Lansat: 03 Jan 2005
Echipa caută un valoros Modul Zero Punct, despre care se zvonește că este ascuns pe planeta Dagan - dar noii lor aliați au motive proprii.
E17: Scrisori din Pegas
Lansat: 10 Jan 2005
Având o mică oportunitate de a trimite o transmisie de date pe Pământ, membrii expediției Atlantida compun mesaje video pe care să le trimită acasă celor dragi.
E18: Darul
Lansat: 17 Jan 2005
Chinuită de coșmaruri teribile, Teyla începe să-și amintească de un moment în care ea și tatăl ei au fost capturați de Wraith și supuși unor experimente răscolitoare.
E19: Asediul (1)
Lansat: 24 Jan 2005
Când un grup de nave-stup Wraith sunt în drum spre Atlantida, echipa caută un loc de refugiu și o modalitate de a distruge orașul. McKay conduce o echipă pentru a încerca să activeze o platfor...
E20: Asediul (2)
Lansat: 31 Jan 2005
Toată speranța pare pierdută, până când colonelul Everett sosește brusc de pe Pământ. El este hotărât să apere orașul până la sosirea unui ZPM, adus de o nouă navă.