E1: Asediul (3)
Lansat: 15 Jul 2005
Daedalus ajunge să apere Atlantida de atacul Wraith, dar poate că nu este suficient atunci când echipa descoperă că o armată și mai mare de Wraith este de pe drum.
E2: Intrusul
Lansat: 22 Jul 2005
Daedalus este infectat de un virus de calculator Wraith, în timp ce membrii expediției speră să se întoarcă pe Pământ.
E3: Fugarul
Lansat: 29 Jul 2005
Sheppard și echipa lui încearcă să-l localizeze pe locotenentul Ford, doar pentru a se găsi captivi ai unui fost soldat care este vânat de Wraith.
E4: Duetul
Lansat: 05 Aug 2005
După o întâlnire avută cu o navă-Săgeată Wraith, conștiința unui tânăr ofițer de securitate al Atlantidei, rămâne prinsă în mintea doctorului McKay.
E5: Condamnați
Lansat: 12 Aug 2005
Echipa Atlantidei găsește o comunitate care trăiește într-o relativă siguranță față de Wraith, pentru că îi predă pe criminalii lor la Wraith - echipa se prăbușeste în colonia penală ...
E6: Treimea
Lansat: 19 Aug 2005
McKay își pune echipa la risc atunci când încearcă să perfecționeze o tehnologie antică neterminată ce a distrus o civilizație. Ronon Dex descoperă că nu este singurul supraviețuitor din ...
E7: Instinctul
Lansat: 26 Aug 2005
Echipa descoperă o fată tânără Wraith, care a fost crescută de un om și se ascunde de oamenii din satul ei uman, temându-se pentru viața ei.
E8: Transformarea
Lansat: 09 Sep 2005
Colonelul Sheppard începe să sufere o transformare fizică tulburătoare după ce a fost expus medicamentului anti-Wraith al lui Beckett.
E9: Aurora
Lansat: 23 Sep 2005
Când echipa descoperă o navă de război antică în derivă pe marginea galaxiei, cu echipajul ei încă în viață, colonelul Sheppard intră în staza lor de realitate virtuală pentru a comunic...
E10: Băieții pierduți
Lansat: 23 Sep 2005
Echipa este capturată de locotenentul Ford, care conduce acum un grup de tineri care iau enzimă Wraith - și care dorește ajutorul echipei pentru un atac sinucigaș împotriva unei nave-stup.
E11: Nava-Stup
Lansat: 16 Nov 2005
Colonelul Sheppard și echipa lui se trezesc prizonieri ai Wraith după atacul lui Ford pe o navă-stup. Dr. McKay se străduiește să-i ajute.
E12: Revelația
Lansat: 28 Nov 2005
Sheppard se află pe o planetă în care timpul trece mai rapid, fără să poată să-si contacteze echipa sau să se întoarcă în Atlantida.
E13: Punctul critic
Lansat: 05 Dec 2005
Când un agent operativ al Trustului pune o bombă în Atlantida, echipa trebuie să găsească un spion în propriile rânduri înainte ca Wraith să sosească și să descopere orașul.
E14: Echilibru sub presiune
Lansat: 10 Dec 2005
Când Dr. McKay este prins sub apă într-un Puddle Jumper ce se scufundă, singura sa șansă de supraviețuire poate fi o halucinație a lui Samantha Carter.
E15: Turnul
Lansat: 19 Dec 2005
Echipa găsește o lume care posedă tehnologie de apărare antică, unde Colonelul Sheppard devine un pion în rivalitatea dintre moștenitorii de la tron.
E16: Lunga despărțire
Lansat: 02 Jan 2006
Echipa descoperă două capsule care conțin mințile unor ființe extraterestre, care preiau controlul asupra trupurilor lui Weir și Sheppard pentru a-și continua războiul lor personal.
E17: Lovitura de stat
Lansat: 09 Jan 2006
După ce o echipă din Atlantida dispare, expediția se află în mijlocul unei lovituri de stat Genii.
E18: Michael
Lansat: 16 Jan 2006
Un tânăr locotenent amnezic din Atlantida suferă de coșmaruri tulburătoare în care el este un Wraith, doar pentru a face o descoperire șocantă despre el însuși.
E19: Infernul
Lansat: 23 Jan 2006
Echipa lui Sheppard întâlnește o civilizație care urmează să fie distrusă de un super-vulcan și este prinsă în capcană atunci când Poarta Stelară este distrusă în timpul evacuării.
E20: Aliați (1)
Lansat: 30 Jan 2006
Michael și grupul lui Wraith, ajung la Atlantida pentru a propune o alianță, sperând să folosească retro-virusul pentru a-și transforma dușmanii Wraith în pradă.