E1: Zod
Lansat: 28 Sep 2006
Aruncat în Phantom Zone, o închisoare kriptoniană creată de tatăl lui biologic, Jor-El, Clark se trezește fără puteri și înconjurat de infractori.
E2: Strănutul
Lansat: 05 Oct 2006
Când Clark lucrează mult prea asiduu pentru a curăța distrugerea lăsată în urmă de Zod, el dezvoltă versiunea kriptoniană a unei răceli.
E3: Estompare
Lansat: 12 Oct 2006
Copleșit în continuare de vinovăție după distrugerea provocată cât era controlat de Zod, Lex organizează un bal mascat caritabil pentru oraș.
E4: Săgeata
Lansat: 19 Oct 2006
În timp ce participă la o strângere de fonduri, Lois vede cum Green Arrow fură un colier cu diamante rare de la gâtul Marthei.
E5: Reuniunea
Lansat: 26 Oct 2006
Lex și Oliver sunt adolescenți care merg la aceeași școală privată, unde Oliver și prietenii lui îl hărțuiesc pe Lex și pe amicul lui, Duncan.
E6: Repercusiuni
Lansat: 02 Nov 2006
Clark e încântat să afle că Raya, fata kriptoniană care l-a ajutat să evadeze din Phantom Zone, a reușit și ea să scape de acolo și e în Smallville.
E7: Furia
Lansat: 09 Nov 2006
Clark află că Green Arrow a fost împușcat în timp ce încerca să salveze un cuplu căruia îi era furată mașina, dar Oliver neagă că a fost rănit.
E8: Paraziţi
Lansat: 16 Nov 2006
Clark află că cineva care a evadat din Phantom Zone a ajuns în Seattle și a ucis întregul echipaj al unui cargobot taiwanez.
E9: În subteran
Lansat: 07 Dec 2006
Clark e șocat să afle că vecinul lui Jed McNally ține captivi muncitori migranți și îi obligă să lucreze la ferma lui.
E10: Acvatica
Lansat: 11 Jan 2007
Lana îi mărturisește lui Chloe că are rezerve legate de căsnicia cu Lex din cauza sentimentelor pe care încă le are pentru Clark.
E11: Dreptate
Lansat: 18 Jan 2007
În acest episod special, Oliver Queen, adică Green Arrow, cheamă întăriri - Bart Allen, alias Impulse, Arthur „AC” Curry, alias Aquaman.
E12: Labirintul
Lansat: 25 Jan 2007
După ce este atacat, Clark se trezește într-un spital psihiatric și i se spune că a fost acolo în ultimii cinci ani.
E13: Rujul roşu
Lansat: 01 Feb 2007
După ce Lois aplică ruj care conține kriptonită roșie, ea devine copleșită de dorință pentru Clark și îi face avansuri.
E14: Încălcarea proprietăţii
Lansat: 08 Feb 2007
După ce primește o fotografie cu ea în cabina de probă, Lana își dă seama că are un hărțuitor și decide să se ascundă într-un loc surprinzător.
E15: Ciudatul
Lansat: 15 Feb 2007
Clark și Chloe descoperă că Tobias are abilitatea de a identifica „ciudații care au legătură cu meteoriții”.
E16: Promisiunea
Lansat: 15 Mar 2007
În ziua nunții lui Lex și a Lanei, Lex primește un apel de la un doctor care amenință să-i spună Lanei adevărul despre bebelușul ei.
E17: Lupta
Lansat: 22 Mar 2007
Clark și Chloe descoperă că Titan, un evadat din Phantom Zone, e vedeta unui fight club secret care transmite în direct imagini cu luptele fatale.
E18: Progenitura
Lansat: 19 Apr 2007
După ce Lex descoperă că mama lui Chloe are puterea de a controla persoane afectate de meteorit, el creează un medicament care s-o trezească.
E19: Duşmănia
Lansat: 26 Apr 2007
După ce Jodi, soția unui soldat din forțele speciale, detonează o bombă artizanală în unul din laboratoarele secrete ale lui Lex, Lionel e grav rănit.
E20: Negru
Lansat: 03 May 2007
Jimmy vede cum ar fi fost viața în Smallville în anii '40. După o întâlnire secretă cu Lionel, Lana e împușcată la Daily Planet.
E21: Prototipul
Lansat: 10 May 2007
Lex a încercat să-l transforme pe Wes Keenan într-un supersoldat, injectându-l cu ADN extras de la diferiții ciudați pe care Lex i-a capturat.
E22: Fantoma
Lansat: 17 May 2007
Clark îl urmărește pe Lionel, ca să-l reducă la tăcere odată pentru totdeauna. Lana îi spune lui Lex că îl părăsește.